<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<rss xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/" version="2.0">
<channel>
<title>Biyoloji</title>
<link>https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/1360</link>
<description>Biology</description>
<pubDate>Tue, 29 Sep 2026 18:59:14 GMT</pubDate>
<dc:date>2026-09-29T18:59:14Z</dc:date>
<item>
<title>The Effect of Curcumin on P53 /TIGAR and Autophagy Pathway in Human Osteosarcoma U2OS Cell Line</title>
<link>https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6379</link>
<description>The Effect of Curcumin on P53 /TIGAR and Autophagy Pathway in Human Osteosarcoma U2OS Cell Line
ABDALLA, Othman Rasw
ABSTRACT:&#13;
Osteosarcoma is a cancer disease from primitive bone tumor initiation and evolution of tubular long bones include femur, humerus and tibia. Osteosarcoma disease is defined and diagnosed throughout the inspection of tumor osteoblast cells that produce osteoid. Turmeric (Curcuma longa) is the most effective component in dried ground rhizomes of a member Zingiberaceae family. Curcumin have excellent free radical scavenging properties, however curcumin is almost the strongest antioxidant present in turmeric. Turmeric seasonal herbaceous plant with long lateral ramifications originally comes from Southeast Asia. Curcumin properties include anticancer, anti-bacterial, anti-inflammatory and antioxidant. Curcumin as chemical therapeutic agent demonstrated to suppress or inhibit various signaling pathways includes arrest tumor cell proliferation, inducing autophagy or apoptosis, inhibit malignant cell invasion and suppressing inflammatory responses. Despite the fact that effects of curcumin in cancer has been broadly reported, but the weather of curcumin on p53/TIGAR and autophagy has not been addressed in osteosarcoma U2OS cell line. In this present study, we screened the weather of curcumin after treated U2OS cells with curcumin, cultured cell were treated by various concentrations (10, 15, 20 and 25) μMolars curcumin intended for 24h. After cultured and treatment cells proliferation and viability were detected by MTT assay. The expression levels of these proteins (p53, TIGAR, Beclin-1 and LC3) were analyzed by immunoblotting assay and the expression of LC3 protein autophagy marker were analyzed by immunocytochemistry assay. The MTT assay results demonstrated that curcumin lead to distinct suppression of osteosarcoma cell proliferation and cell viability. There were observed a linear dose/depends effect for curcumin range 15-25 μM dose cause to modulate of p53, TIGAR, Beclin1 and LC3. Analysed protein reveals a relation reduction in the levels of p53 and TIGAR proteins above treatment with 10–25 μM curcumin. The result of immunocytochemistry showed that by increasing curcumin dose significantly increased the expression of the total amount LC3 protein in cytoplasm osteosarcoma U2OS cells. Our studied has improved the perceptive of the fundamental technique anticancer properties of curcumin.; ÖZET:&#13;
Osteosarkom, kemiklerde en sık rastlanan primer tümörlerdir ve genellikle tibia, femur, humerus gibi uzun boru şekilli kemiklerin metafizi çevresinde ortaya çıkar. Curcumin, Curcuma longa L'nin kurutulmuş toprak rizomlarındaki en önemli etkiye sahip bileşendir. Yara iyileşmesini destekler, karaciğer hasarına, katarakt oluşumuna ve pulmoner toksisiteye karşı koruma sağlar. Curcumin (zerdeçal) geleneksel Çin tıbbında binlerce yıldır kullanılmaktadır. Anti-bakteriyel, anti-inflamatuvar, anti-oksidan ve anti-kanser özellikleri de dahil olmak üzere birçok farmakolojik etkiue sahip olduğu bildirilmiştir. Curcumin’in, hücre invazyonunu engellemek, migrasyonu ve inflamatuar yanıtları bastırmak, apoptoz veya otofajiyi tetiklemek birçok etkisinin olduğu kanıtlanmıştır. Kansere karşı curcumin etkilerinin kapsamlı bir şekilde araştırılmış olmasına rağmen curcumin'in p53 / TIGAR ve otofajik yolak üzerindeki etkisi U2OS hücre hattında henüz ele alınmamıştır. Bu nedenle insan osteosarkom U2OS hücre hattında curcuminin p53 / TIGAR ve otofaji yolu üzerindeki etkisininin araştırılması amaçlanmıştır. Osteosarkom U2OS hücreleri 24 saat süreyle farklı konsantrasyonlarda (10, 15, 20 ve 25 μM) curcumin ile tedavi edildi. Hücre çoğalması hücre canlılık testi olan MTT ile saptanmıştır. Bu proteinlerin (p53, TIGAR, Beclin-1 ve LC3) ekspresyon seviyeleri, western blotting ile analiz edilmiştir. MTT analizinin sonuçları, curcumin'in osteosarkom hücre proliferasyonunun ve hücre canlılığının inhibisyonuna neden olduğunu göstermiştir. Curcumin aralığı 15-25 μM doz ve p53, TIGAR, Beclin1 ve LC3 modülasyonu için doza / bağımlı doğrusal bir etkisinin olduğu belirlenmiştir. Osteosarkom U2OS hücre hattı 15-25 uM curcumin ile tedavi edildiğinde p53 ve TIGAR protein seviyelerinde bir düşüş olduğu ortaya konmuştur. Beclin-1'in curcumin tarafından inhibe edilmesi otofajiye spesifik belirteç olan mikrotübüle bağlı protein LC3’nin artmasına yol açmaktadır. Immünositokimya sonucunda curcumin dozunun artmasıyla total LC3 proteininin ekspresyonunun belirgin şekilde arttığı gösterilmiştir. Bu bulgular, curcumin'in antikanser özelliklerinin altında yatan mekanizmanın anlaşılmasını geliştirmiştir.
</description>
<pubDate>Mon, 01 Jan 2018 00:00:00 GMT</pubDate>
<guid isPermaLink="false">https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6379</guid>
<dc:date>2018-01-01T00:00:00Z</dc:date>
</item>
<item>
<title>Deciphering the Role of Knockdown Tigar in the Lung Cancer Cell Line Through Regulation Programmed Cell Death</title>
<link>https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6375</link>
<description>Deciphering the Role of Knockdown Tigar in the Lung Cancer Cell Line Through Regulation Programmed Cell Death
SHAREEF, Osama Hamid
ABSTRACT:&#13;
Non-small cell lung cancer has a high mortality rate with a lethal malignancy. siRNA is the most-commonly used RNA interference tool for inducing short-term silencing of protein-coding genes in the post-transcriptional process as negative regulators of gene expression. The TIGAR protein controls Fru-2, 6-P2 levels during glucose metabolism and helps maintain NADPH levels to recycle GSH, a key intracellular antioxidant. One of TIGAR’s functions is to lower Fru-2, 6-P2 levels in cells, consequently decreasing glycolysis and suppressing ROS, which correlate with higher resistance to cell death. However, little is known about the effects of siRNA on cell viability, oxidative stress, and programmed cell deaths, or about how siRNA interacts with TIGAR in lung cancer cells. The present study was designed to investigate the molecular mechanisms underlying TIGAR knockdown in the A549 cell line.&#13;
To detect the influence of siRNA-TIGAR on A549 lung cancer cells, we performed cell proliferation, colony formation, ROS, and NADPH assays to measure cell viability, ability of cells to form colonies, and oxidative stress levels of ROS and NADPH, respectively. In addition, western blotting and real-time PCR assays were used to measure protein and mRNA expression levels, respectively.&#13;
After TIGAR-knockdown in A549 cell lines, various assay parameters were analyzed and showed that down regulation of TIGAR inhibited viability and decreased colony formation. We also demonstrated that TIGAR knockdown induced apoptosis and autophagy. Furthermore, increased ROS levels and decreased NADPH levels were observed, followed by an induction of oxidative stress marker expression. In summary, siRNA TIGAR inhibited cell viability, enhanced programmed cell deaths (I, II), and elevated oxidative stress markers by increasing ROS levels.&#13;
The data showed that TIGAR knockdown induced inhibition of cell viability; increased ROS levels; and decreased NADPH levels, induction of autophagy and apoptosis, and oxidative stress markers. Overall, this study supports our understanding the possibility of using TIGAR knockdown in lung cancer cells to enhance programmed cell death I, II for further use as a therapeutic target in cancer treatment.; ÖZET:&#13;
Küçük hücreli olmayan akciğer kanseri ölümcül bir malignite ile yüksek mortalite oranına sahiptir. siRNA, gen ifadesinin negatif düzenleyicileri olarak transkripsiyon sonrası süreçte protein kodlayan genlerin kısa süreli susturulmasını indüklemek için en yaygın kullanılan RNA interferens aracıdır. TIGAR proteini,glikoz metabolizması sırasında Fru-2, 6-P2 seviyelerini kontrol eder ve NADPH düzeyini devam ettirerek hücre içi önemli birantioksidan olan GSH'nin geri dönüştürmesine yardımcı olur. TIGAR'ın işlevlerinden biri, hücrelerdeki Fru-2, 6-P2 seviyelerini düşürmek ve sonuç olarak hücre ölümüne karşı daha yüksek dirençle korele olan ROS'u baskılamak ve glikolizi azaltmaktır. Bununla birlikte, siRNA'nın hücre canlılığı, oksidatif stres ve programlanmış hücre ölümleri üzerindeki etkileri veya siRNA'nın akciğer kanseri hücrelerinde TIGAR ile nasıl etkileştiği hakkında pek az şey bilinmektedir. Bu çalışma, A549 hücre hattında TIGAR'ın susturulmasının altında yatan moleküler mekanizmaları araştırmak için tasarlanmıştır.siRNA-TIGAR'ın A549 akciğer kanseri hücreleri üzerindeki etkisini saptamak için hücre canlılığını, koloni oluşumunu, ROS ve NADPH'nin oksidatif stres seviyelerini ve hücre canlılığını ölçmek için sırasıyla hücre proliferasyonu, koloni oluşumu, ROS ve NADPH analizleri gerçekleştirdik. Ek olarak, protein ve mRNA ekspresyon seviyelerini ölçmek için sırasıyla western blot ve real-time PCR analizleri kullanıldı.A549 hücre hattında TIGAR inaktif edildikten sonra çeşitli parametreler analiz edildi ve TIGAR'ın down regülasyonunun canlılığı inhibe ettiği ve koloni oluşumunu azalttığı gösterildi. Ayrıca TIGAR inaktivasyonunun apoptozis ve otofajiyi tetiklediği görüldü. Artmış ROS seviyeleri ve azalmış NADPH seviyelerine bağlı olarak oksidatif stres belirteçlerinin indüksiyonu gözlemlendi. Özetle, siRNA TIGAR hücre canlılığını inhibe edip programlanmış hücre ölümlerini (I, II) arttırmıştır ve ROS seviyesini artırarak yüksek oksidatif stres markırlarını yüksek düzeylere çıkarmıştır. Bulgular, TIGAR’ı susturmanın hücre canlılığı inhibisyonunu indüklediğini, ROS seviyelerini artırdığını, NADPH düzeylerini azalttığını, otofaji, apoptosis ve oksidatif stres belirteçlerini indüklediğini gösterdi. Genel olarak, bu çalışma kanser tedavisinde terapötik bir hedef olarak kullanılmak üzere akciğer kanseri hücrelerinde programlanmış hücre ölümü I, II'yi arttırmak için TIGAR susturmanın muhtemel rolünün anlaşılmasını desteklemektedir.
</description>
<pubDate>Tue, 01 Jan 2019 00:00:00 GMT</pubDate>
<guid isPermaLink="false">https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6375</guid>
<dc:date>2019-01-01T00:00:00Z</dc:date>
</item>
<item>
<title>Bingöl İli Harpalınae (Coleoptera: Carabıdae) Altfamilyası Üzerine Faunastik ve Sistematik Çalışmalar</title>
<link>https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6372</link>
<description>Bingöl İli Harpalınae (Coleoptera: Carabıdae) Altfamilyası Üzerine Faunastik ve Sistematik Çalışmalar
DİNLER, Nihat
ÖZET:&#13;
Bu çalışmada 2014-2016 yılları arasında Bingöl ili sınırları içerisinden toplanan Harpalinae (Coloeptera: Carabidae) altfamilyasına ait türler, faunustik ve sistematik açıdan araştırılmıştır. Araştırma alanından çukur tuzaklar ve el ile toplanan 550 örneğin incelenmesi sonucunda Harpalinae altfamilyasına ait 4 cins ve 13 tür Acinopus (Acinopus) laevigatus Ménétriés, 1832; Acinopus (Acinopus) picipes (Olivier, 1795); Dixus (Dixus) eremita (Dejean, 1825); Dixus (Dixus) obscurus (Dejean, 1825); Harpalus (Harpalus) affinis (Schrank, 1781); Harpalus (Harpalus) attenuatus Stephens, 1828; Harpalus (Harpalus) caspius (Steven, 1806); Harpalus (Harpalophonus) hospes (Sturm, 1818); Harpalus (Harpalus) latus (Linnaeus, 1758); Harpalus (Harpalus) serripes (Quensel, 1806); Harpalus (Harpalus) smaragdinus (Duftschmid, 1812); Ophonus (Hesperophonus) cribricollis (Dejean, 1829); Ophonus (Metophonus) puncticollis (Paykull,1798) tespit edilmiştir.&#13;
Ayrıca çalışma alanında incelenen türlerin fotoğrafları, morfolojileri, dünya ve Türkiye‟de yayılış alanları verilmiştir. Elde edilen örnekler Bingöl Üniversitesi Zooloji laboratuvarında saklanmaktadır.; ABSTRACT:&#13;
In this study, the species belonging to Harpalinae (Coloeptera: Carabidae) subfamily collected from Bingöl province between 2014-2016 were investigated in terms of faunoustics and systematic aspects. 13 species Acinopus (Acinopus) laevigatus Ménétriés, 1832; Acinopus (Acinopus) picipes (Olivier, 1795); Dixus (Dixus) eremita (Dejean, 1825); belonging to Harpalinae subfamily and collected by hand traps and pit traps (550 samples from the study area). Dixus (Dixus) obscurus (Dejean, 1825); Harpalus (Harpalus) affinis (Schrank, 1781); Harpalus (Harpalus) attenuatus Stephens, 1828; Harpalus (Harpalus) caspius (Steven, 1806); Harpalus (Harpalophonus) hospes (Sturm, 1818); Harpalus (Harpalus) latus (Linnaeus, 1758); Harpalus (Harpalus) serripes (Quensel, 1806); Harpalus (Harpalus) smaragdinus (Duftschmid, 1812); Ophonus (Hesperophonus) cribricollis (Dejean, 1829); Ophonus (Metophonus) puncticollis (Paykull,1798).&#13;
Also photos of the species examined in the study area, morphology, distribution in the world and Turkey are given. Samples are stored in Bingol University Zoology laboratory.
</description>
<pubDate>Tue, 01 Jan 2019 00:00:00 GMT</pubDate>
<guid isPermaLink="false">https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6372</guid>
<dc:date>2019-01-01T00:00:00Z</dc:date>
</item>
<item>
<title>C60 Fullerene'nin A549 İnsan Akciğer Kanseri Hücre Hattında Otofajik Markerlar Üzerine Etkisi</title>
<link>https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6363</link>
<description>C60 Fullerene'nin A549 İnsan Akciğer Kanseri Hücre Hattında Otofajik Markerlar Üzerine Etkisi
YILDIRIM, Mahmut
ÖZET:&#13;
Akciğer kanseri dünyada en sık görülen kanser türüdür. A549 akciğer kanseri hücre hattı, biyoaktif bileşiklerin kemoterapi etkisini incelemek için uygun bir modeldir. Nanopartiküller C60 fullerene, güçlü bir antioksidan olarak kabul edilir ve antikanser aktivitesi gösterir. Karbon nanopartikülleri, fullerenlerin küresel simetrik yapıda birleştirilmiş atomlara sahip olmasından dolayı benzersiz özelliklere sahiptir. Nanopartikül moleküllerinin kendine özgü kimyasal ve fiziksel özellikleri, minimal konsantrasyonlarda bile etkin hareket etmelerini sağlar. Pek çok kemoterapi ajanının aksine fulleren, geniş konsantrasyonlarda normal ve malign olmayan hücreler için toksik değildir. C60 fullerenin kanserdeki etkisi kapsamlı bir şekilde araştırılmasına rağmen, A549 hücre hattında otofaji ve apoptozisin potansiyel regülasyonu ele alınmamıştır. Bu çalışmada C60 fullerenin insan A549 akciğer kanseri hücre hattında apoptoz ve otofaji yolu üzerindeki etkisi araştırılmıştır. A549 hücreleri 24 saat boyunca farklı ve düşük konsantrasyonlarda (100, 250 ve 500 nM) C60 fulleren ile tedavi edildi. Hücre canlılığı MTT testi ile tespit edildi. ROS seviyeleri DCFD-A testi ile ölçüldü. p53, Bax, Beclin1 ve TIGAR protein ekspresyonlarındaki değişiklikler western blot tekniği ile analiz edildi. MTT ve DCFD-A analizinin sonuçları, düşük dozdaki C60 fullerenin, A549 hücre hattında; hücre canlılığı ve ROS seviyesi üzerinde anlamlı bir etkisinin olmadığını göstermiştir. C60 fullerene sahip A549 hücreleri, düşük dozlarda p53, Bax ve TIGAR proteinleri ekspresyon seviyelerinde artışa neden olurken, Beclin1 proteinleri ekspresyon seviyesi konsantrasyona bağlı bir şekilde artmıştır. Genel olarak, bulgularımız suda çözünebilir C60 fullerenin A549 hücrelerinde apoptozisi ve otofajiyi indüklediğini göstermektedir. Bulgularımız akciğer kanseri hücrelerinde C60 fullerenin etki mekanizmalarına ışık tuttuğunu düşünmekteyiz.; ABSTRACT:&#13;
Lung cancer is the most common type of cancer in the world. The A549 lung cancer cell line is suitable model to study chemotherapy effect of variuos bioactive compounds. Nanoparticles C60 fullerene are recognized as the power antioxidant and demonstrate anticancer activity. Carbon nanoparticles posses unique properties due to the fact that fullerenes have the atoms combined in spherical symmetric structure. Peculiar chemical and physical properties of nanosized molecules enable them to act effectively in minimal concentrations. In contrast to many chemotherapy agents, this fullerene absolutely non-toxic for a normal non-malignated cells in wide range of concentrations. Despite the fact that, the effect of C60 fullerene in cancer has been extensively studied, the potential regulation of autophagy and apoptosis has not been addressed in A549 cell line. Therefore, we investigated the effect of C60 fullerene on apoptosis and autophagy pathway on human A549 lung cancer cell line. A549 cells were treated with different low concentrations (100, 250 and 500 nM) C60 fullerene for 24 hours. Cell viability were detected by MTT assay. ROS levels were measured by DCFD-A assay. The changes of p53, Bax, Beclin1 and TIGAR protein expressions were analysed by western blotting. The results of MTT and DCFD-A assay showed that low dose C60 fullerene has no effect on cell viability and ROS level in A549 cell line respectively. The treatment A549 cells with C60 fullerene caused p53, Bax, and TIGAR proteins expression level increase in lowest dose, while Beclin1 proteins expression level increased in concentration-depend manner. Overall, our findings have suggested that water-soluble C60 fullerene induces apoptosis as well as autophagy in A549 cells. Our findings shed light on the mechanisms of C60 fullerene effect in Lung cancer cells.
</description>
<pubDate>Mon, 01 Jan 2018 00:00:00 GMT</pubDate>
<guid isPermaLink="false">https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6363</guid>
<dc:date>2018-01-01T00:00:00Z</dc:date>
</item>
</channel>
</rss>
