https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/1364 Chemistry Sat, 14 Nov 2026 15:54:05 GMT 2026-11-14T15:54:05Z https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6500 Sütte Bulunan Eksozomların Nano-LC Sisteminde Analizi GÜNYEL, Zeynep ÖZET: Bu tez çalışmasının amacı, ters faz nano-sıvı kromatografisi (nano-LC) için yeni metakriloil grafen oksit nano partikül (MGONP) bazlı hidrofobisitesi artırılmış monolitik nano kolonların hazırlanması ve bu kolonların süt numunelerinden eksozomların ayrımı ve analizi için nano-LC sisteminde kullanılması olarak belirlenmiştir. Bu bağlamda, çalışma kapsamında MGONP’leri grafit kullanılarak elde edilmiş ve MGONP içeriğine sahip monolitler hazırlanarak karakterizasyon çalışmaları yapılmıştır. İlk olarak, monolitik kolonlar, butilmetakrilat (BMA), etilen dimetakrilat (EDMA) ve MGONP içeren solüsyonlar hazırlanmış, porojenik çözücü olarak dimetilformamid (DMF) ve su kullanılmıştır. Hazırlanan polimerik solüsyon 50 μm i.d.’lik fused silika kapiler kolonlar içerisine enjekte edilerek in-situ polimerizasyon yöntemi ile monolitik kolonlar hazırlanmıştır. Hazırlanan kolonların hidrofobisitesinin artırılması için, kolonlar dimetiloktadesilklorosilan (DODCS) ile modifiye edilmiştir. Karakterizasyon için monolitik kolonların morfolojik yapıları SEM görüntüleri ve FT-IR analizleri ile incelenmiştir. Ayrıca, hazırlanan monolitik nano kolonların kromatografik karakterizasyonu nano-LC’de alkilbenzen homologları kullanılarak yapılmıştır. Karakterizasyonu yapılmış monolitik kolonlar kullanılarak nano-LC sisteminde sütten ekstrakte edilen eksozom ayırımı ve analizi için kromatografik optimizasyon çalışmaları yapılmıştır. Eksozomlar karakterizasyon ve tanımlamaları için NTA, SEM, FT-IR kullanılmış ve sonrasında etkin olarak nano-LC’de kromotografik analizleri yapılmıştır. Geliştirlen yöntemin etkin sonuç verdiği ve yeni bir yaklaşımla eksozom izolasyon yöntemi geliştirilmiş olduğu görülmüştür.; ABSTRACT: The aim of this thesis is to prepare methacryloyl graphene oxide nanoparticles (MGONPs) based monolithic nano-columns with increasin hydrophobicity for the separation and analysis of exosomes in milk samples. In this thesis, graphite was used for the synthesis of MGONPs and the preparation adn characterization of the developed monolithic columns were performed. Firstly, the monolithic columns are prepared using polymeric solutions composing of BMA EDMA and MGONPs and DMF/H2O as porogenic solvent. The final solution for monolithic column preparation was injected into the fudes silica capillary column with 50 μm i.d. in order to make in-situ polymerization. Final monolithic columns are modified for the increasing their hydrophobicity, which is neccessary for exosome separation and analysis. SEM images and FT-IR are applied for the characterization of monolithic columns as well as chromatographic characterization with homologous alkylbenzenes. The characterized monolithic olumns are applied for the separation and analaysis of exosomes in milk samples by using reversed-pahse nano-LC. In addtion to nano-LC studies, NTA, SEM and FT-IR are used for the tandem characterization of exosomes. All results shows that the developed tecnique is a novel and promising methadology for exosome isolation and it is proposed as a novel approach for exosome isolation. Sun, 01 Jan 2023 00:00:00 GMT https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6500 2023-01-01T00:00:00Z https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6419 UPD Temeline Dayanan Elektrokimyasal Depozisyon Yöntemi ile Güneş Pili Nanomalzemelerinin Geliştirilmesi DEMİRKOL, Şamil ÖZET: Bu tez kapsamında, bileşik yarıiletken Cu2O nanoyapıları, yüzey sınırlı reaksiyonlara dayanan elektrokimyasal depozisyon tekniğinden yararlanılarak hazırlandı. UPD bölgesinde hazırlanan Cu2O nanoyapıları, aynı şartlar altında bulk (Nernst) depozisyon bölgesinde hazırlanan Cu2O depozitleri ile karşılaştırıldı. Bulk depozisyon bölgesindeki 3 boyutlu büyüme kinetiğinin aksine, UPD bölgesinde 2 boyutlu bir büyüme kinetiği söz konusudur. Cu2O yarıiletkeni, tüm bazik pH’larda elektrokimyasal olarak hazırlanmaya çalışıldı. Bu pH değerleri içinde, Cu2O yarıiletkenini elektrokimyasal olarak hazırlamak için en ideal pH değeri belirlenmeye çalışıldı. Elektrodepozisyon çözeltisinin pH’sının bir fonksiyonu olarak nanoyapıların boyutlarının değişimi incelendi. Çözeltilerin pH değerleri arttığında, elektrokimyasal olarak hazırlanan Cu2O nanoyapıların boyutları azaldı. SEM görüntüleri UPD bölgesinde elektrokimyasal olarak hazırlanan Cu2O’in mükemmel tek tip nanoküp şeklinde yapılarla elde edilebileceğini gösterdi.Cu2O nanoyapılarının kalitatif ve kantitatif analizleri, yapıda sadece Cu ve O bulunduğunu ve stokiyometrinin 2/1 (Cu/O) oranına sahip olduğunu gösterdi. FT-IR spektroskopi sonuçları, Cu2O nanoküplerinin tek faza sahip bir kristalin doğası ile elde edilebileceğini doğrulamıştır. PL spektroskopi sonucunda elde edilen keskin band, Cu2O emisyonundan kaynaklanır ve kristal yapıda Cu2O oluşumunu doğrular. Elektrokimyasal olarak hazırlanan bakır (I) oksit yapılarına ait bant aralığı enerjisi 2,09 eV’tur. Bu çalışmada elektrokimyasal olarak hazırlanan Cu2O yarıiletkeni, güneş pillerinde ideal bir soğurucu tabaka olarak kullanılmak üzere önerilebilir.; ABSTRACT: In this thesis, compound semiconductor Cu2O nanostructures were prepared by the electrochemical deposition method based on surface-limited reactions. Cu2O nanostructures prepared in UPD region were compared with Cu2O deposits prepared in bulk (Nernst) deposition region under the same conditions. In contrast to 3D growth kinetics in bulk deposition region, there are 2D growth kinetics in UPD region. Electrochemical preparation of Cu2O semiconductor in all basic pH was attempted. In these pH values, it was tried to determine the most ideal pH value to electrochemically prepare of Cu2O semiconductor. Changes in the size of nanostructures as a function of pH of the electrodeposition solution were investigated. When pH values of the solutions were increased, the sizes of Cu2O nanostructures prepared by electrochemical deposition were decreased. SEM images showed that Cu2O prepared by electrochemically in UPD region can be obtained with structures shaped like perfect single type nanocube. The qualitative and quantitative analysis of Cu2O nanostructures indicated that the structure have only Cu and O and stoichiometry have 2/1 (Cu/O) ratio. FT-IR spectroscopy results confirmed that Cu2O nanocubes can be obtained with the single phase crystalline nature. The sharp band obtained by PL spectroscopy is due to Cu2O emission and confirms the formation of crystalline Cu2O. The band gap energy of the structures of copper (I) oxide prepared electrochemically is 2.09 eV. In this study, Cu2O semiconductor prepared electrochemically may be recommended to be used as an ideal absorber layer in the solar cells. Wed, 01 Jan 2014 00:00:00 GMT https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6419 2014-01-01T00:00:00Z https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6408 Glutatyon S-Transferaz (GST) Enziminin Tavuk Yüreğinden Saflaştırılması ve Karakterizasyonu ZOR, Suat ÖZET: Glutatyon S-transferaz enzimi (GST; EC 2.5.1.18) metabolizmada önemli bir antioksidan enzimdir ve glutatyonun toksisite oluşturabilecek birçok metabolitle konjugasyonunu sağlayan reaksiyonlarda görev alır. Bu tez kapsamında, GST enzimi tavuk yüreğinden homojenatın hazırlanması, amonyum sülfat çöktürmesi ve glutatyon-agaroz afinite kromatografisi vasıtasıyla 9,048 EÜ/mg protein spesifik aktivite ve %40 verimle 20,99 kat saflaştırıldı. Daha sonra enzim saflığının kontrol edilmesi ve alt birim molekül kütlesinin belirlenmesi amacıyla sodyum dodesil sülfat poliakrilamit jel elektroforezi (SDS-PAGE) yapılarak tek bant elde edildi. SDS-PAGE ile saflaştırılan GST enziminin alt birim molekül kütlesi yaklaşık 20,94 kDa olarak bulundu. Saflaştırılan GST enzimi için yapılan karakterizasyon çalışmalarında optimum pH, (Tris-HCI tamponunda) pH= 8,5, optimum iyonik şiddet, (Tris-HCI tamponunda) 0,2 M, stabil pH, (Tris-HCI tamponunda) pH = 8,5 ve optimum sıcaklık 60 oC olarak bulundu. Ayrıca Lineweaver-Burk grafiklerinden faydalanılarak enzime ait KM ve Vmax değerleri sırasıyla GSH substratı için KM, 0,087 mM, Vmax 0,625 EÜ/mL; CDNB substratı için KM, 0,798 mM, Vmax, 1,141 EÜ/ mL olarak hesaplandı.; ABSTRACT: Glutathione S-transferase enzyme (GST; EC 2.5.1.18) is an important antioxidant enzyme in metabolism and takes part in reactions that provide conjugation of glutathione with many metabolites that may cause toxicity. Within the scope of this thesis, the GST enzyme, which has 9,048 EU/mg protein specific activity, was purified 20.99-fold with 40% yield by means of preparation of homogenate from chicken heart, ammonium sulfate precipitation and glutathione-agarose affinity chromatography. Then, sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) was performed to control the enzyme purity and to determine the subunit molecular mass, and a single band was obtained. The subunit molecular mass of the GST enzyme purified by SDS-PAGE was found to be approximately 20.94 kDa. In the characterization studies for the additionally purified GST enzyme, optimum pH (in Tris-HCl buffer) pH= 8.5, optimum ionic strength (in Tris-HCl buffer) 0.2 M, stable pH, (in Tris-HCl buffer) pH = 8, 5 and the optimum temperature is 60 oC; also, using Lineweaver-Burk graphs, the KM and Vmax values of the enzyme were determined as KM, 0.087 mM, Vmax 0.625 EÜ/mL for the GSH substrate; For CDNB substrate, KM was calculated as 0.798 mM, Vmax was calculated as 1.141 EU/mL. Sun, 01 Jan 2023 00:00:00 GMT https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6408 2023-01-01T00:00:00Z https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6406 Purification and Characterization of Glutathione Reductase From Japanese Quail (Coturnix Coturnix Japonica) Liver MOHAMMED TAHER, Sarkat Salim ABSTRACT: In this study, glutathione reductase (Glutathione: NADP+ oxidoreductase, E.C 1.8.1.7; GR) was purified from quail`s liver by using ammonium sulfate precipitation and 2',5'-ADP Sepharose-4B gel affinity chromatography. GR enzyme was obtained having a specific activity of 22.75 EU/mg proteins, with a yield 13.6% and 142.18 purification fold. Enzymatic activity was measured spectrofotometrically according to Beutler`s method at 340 nm. Subunits molecular weight of enzyme was determined by SDS-PAGE as 59 kDa. Optimal pH, optimal ionic strength, stable pH, optimal temperature were determined as 8.0, 0.6 mM, 8.0, 85 °C respectively. Also KM and Vmax values were determined for NADPH as 0.109 mM and 0.603 EU/mL; and for GSSG substrates 0.044 mM and 0.272 EU/mL respectively.; ÖZET: Yüksek lisans tezi olarak sunuçu bu çalşmadan, glutatyon redüktaz (Glutatyon: NADP+, oksidoredüktaz, E.C 1.8.1.7.; GR) enzimi bıldırcın karaciğerinden amonyum sülfat çöktürmesi ve 2',5'-ADP Sepharose-4B afinite kromatografisi olmak üzere 2 basamakta saflaştırıldı. 22,75 EÜ/mg protin spesifik aktivitesine sahip olan GR enzimi %13,6 verimle, 142,18 kat saflaştırıldı. Enzim aktivitesi spektrofotometrik olarak 340 nm‟de Beutler metoduna göre ölçüldü. Enzimin alt biriminin mol kütlesi ise SDS-PAGE ile 59 kDa olarak bulundu. Enzim için optimum pH, optimum iyonik şiddet, optimum sıcaklık, stabil pH, sırasıyla 8, 100 mM, 8, ve 85ºC olarak bulundu. Ayrıca NADPH için KM değeri 0,109 mM ve Vmax değeri 0,603 EÜ/mL olarak; GSSG için ise, KM değeri 0,044 mM ve Vmax değeri 0,272 EÜ/mL olarak tespit edildi. Sun, 01 Jan 2017 00:00:00 GMT https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6406 2017-01-01T00:00:00Z