Fen Bilimleri Enstitüsü

Hydrophilinae (Coleoptera: Hydrophilidae) Alt Familyasına Ait Bazı Böcek Türlerinden Elde Edilecek Protein Ekstraktlarının Anti Kanser Özelliklerinin Belirlenmesi

2019-01-01T00:00:00Z

Hydrophilinae (Coleoptera: Hydrophilidae) Alt Familyasına Ait Bazı Böcek Türlerinden Elde Edilecek Protein Ekstraktlarının Anti Kanser Özelliklerinin Belirlenmesi ÖZCAN, Seher ÖZET Bu çalışmada hydrophilinae (Coleoptera: Hydrophilidae) Alt Familyasının Hydrochara dichroma ve Hydrophilus piceus türlerinin protein özütlerinin elde edilmesi yolunda hareket edilmiştir. Elde edilen Protein miktarları Bradford yöntemi ile hesaplanmış ve Hydrochara dichroma türünün absorbans değeri 0,4144 mg iken, Hydrophilus piceus türünün ise absorbans değeri 0,3411mg. olarak belirlenmiştir. Hazırlanan bu örnekler hücre kültürüne alınarak prostat kanser hattı hücrelerinde (PC3) WST-1 ile hücre canlılık testi yapılmıştır. Test sonucu incelendiğinde çalışılan iki tür içinde protein ekstrelerinin hücre inhibisyonun’da düşmeye sebebiyet verdiği gözlemlenmiştir. En yüksek hücre inhibisyonu 1000 mg/ml böcek protein ekstraktı eklenmiş örneklerde gözlemlenmiştir. Daha sonra etkin doz bulunmuş olup western blot tekniği ile protein ürünlerine bakılmıştır. Bu çalışmanın sonucu olarak diyebiliriz ki western blot tekniğinde böcek proteinlerinin hücre ölümünü sağlayacak olan proteinlerin üretimini desteklediği görülmüştür.; ABSTRACT: In this study, we aimed to obtain protein extracts of Hydrochara dichroma and Hydrophilus piceus from HYDROPHİLİNAE (COLEOPTERA: Hydrophilidae). The amount of protein obtained was calculated by Bradford method and the absorbance value of Hydrochara dichroma was 0.4144 mg, while the absorbance value of Hydrophilus piceus was 0.3411mg. as determined. Cell viability test was performed with WST-1 in prostate cancer line cells (PC3). When the test result was examined, it was observed that protein extracts caused decrease in cell inhibition in the two species studied. The highest cell inhibition was observed in samples with 1000 mg / ml insect protein extract added. Then the effective dose was found and protein products were examined by western blot technique. As a result of this study, we can say that the western blot technique has been shown to support the production of insect proteins that will enable cell death.

Bazı Kuru Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) Genotiplerinin Bingöl Koşullarındaki Verim ve Verim Özelliklerinin Belirlenmesi

2019-01-01T00:00:00Z

Bazı Kuru Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) Genotiplerinin Bingöl Koşullarındaki Verim ve Verim Özelliklerinin Belirlenmesi SERENGÜL, Serhat ÖZET: Bu çalışma bazı kuru fasulye (Phaseolus vulgaris L.) genotiplerinin Bingöl koşullarında verim ve verim özeliklerini belirlemek amacıyla, 2017 yılı yetiştirme döneminde Bingöl ili Genç ilçesi Çevirme Köyü’nde yürütülmüştür. Denemede 10 adet kuru fasulye genotipi (6 adet çeşit ve 4 adet yerel populasyon) ile tesadüf blokları deneme desenine göre dört tekerrürlü olarak kurulmuştur. Araştırmada kullanılan kuru fasulye genotiplerine ait metrekarede bitki sayısı, bitki boyu, ilk bakla yüksekliği, ana dal sayısı, bitkide bakla sayısı, bitkide tane sayısı, bitkide tane verimi, 100 tane ağırlığı, biyolojik verim, tane verimi, hasat indeksi, çıkış süresi, çiçeklenme süresi ve vejetasyon süresi değerlerine ait gözlem ve ölçümler yapılmıştır. Çalışmamızda metrekarede bitki sayısı 10,88-15,00 adet, bitki boyu 43,52-95,07 cm, ilk bakla yüksekliği 8,62-16,45 cm, ana dal sayısı 1,82-2,05 adet, bitkide bakla sayısı 13,97-26,52 adet, bitkide tane sayısı 42,00-100,30 adet, bitkide tane verimi 20,50-32,65 g, 100 tane ağırlığı 28,17-49,48 g, biyolojik verim 459,85-612,10 kg/da, tane verimi 183,68-326,33 kg/da, hasat indeksi %27,75- %47,68, çıkış süresi 10,25-12,75 gün, çiçeklenme süresi 34,00-37,50 gün ve vejetasyon süresi 81,00-95,50 gün arasında değişim göstermişlerdir. Sonuç olarak; 326,33 kg/da ile araştırmada kullanılan bütün genotipler arasında en yüksek verimli çeşit olarak belirlenen Kantar-05 çeşidi, 14,88 adet m2‘de bitki sayısına, 86,55 cm bitki boyuna, 8,62 cm ile ilk bakla yüksekliğine, 1,82 adet ana dal sayısına, 17,90 adet bitkide bakla sayısına, 79,70 adet bitkide tane sayısına, 32,65 g bitkide tane verimine, 40,28 g 100 tane ağırlığına, 607,05 kg/da biyolojik verime, 326,33 kg/da tane verimine, %47,68 hasat indeksine, 10,25 gün çıkış süresine, 34,00 gün çiçeklenme süresine ve 82,25 gün vejetasyon süresine sahip olmuştur.; ABSTRACT: This study was conducted in order to determinate some yield and yield components of some common bean (Phaseolus vulgaris L.) genotypes under Çevirme village of Genç town of Bingöl city in 2017 growing season. The experiment was arranged in randomized complete block design with three replications with 10 common bean genotypes (6 commercial cultivars and 4 local populations). Data were collected on some agronomic and morphological characteristics such as, number of plant in square meters, plant height, number of main brunch, number of pod in a plant, number of grain in a plant, grain yield in a plant, 100 grain weight, biological yield, harvest index, time of emergence, time of flowering and vegetation period. The characteristics observed in our study varied among 10.88-15.00 number in plant density, 43.52-95.07 cm in plant height, 8.62-16.45 cm in first pod height, 1.82-2.05 number in number of main brunch, 13.97-26.52 number in pod number in a plant, 42.00-100.30 number in grain number in a plant, 20.50-32.65 g in grain yield per a plant, 28.17-49.48 g in 100 grain weight, 459.85-612.10 kg/da in biological yield, 183.68-326.33 kg/da in grain yield, 27.75-47.68 % in harvest index, 10.25-12.75 days in time of emergence, 34.00-37.50 days in time of flowering and 81.00-95.50 days in vegetation period. As a result; the highest yielding cultivar Kantar-05 with yield of 326.33 kg/da among the genotypes used in the study had 14.88 number of plant in a square meters, 86.55 cm of plant height, 8.62 cm of first pod height, 1.82 number of main brunch, 17.90 number of pod per plant, 79.70 number of grain in a plant, 32.65 g of plant yield, 40.28 g of 100 grain weight, 607.05 kg/da of biological yield, 326.33 kg/da of grain yield, 47.68 % of harvest index, 10.25 days of emergence time, 34.00 days of flowering time and 82.25 days of vegetation period.

The Association of Epstein –Barr Virus Infection with Progress of Cancer and Immune Defects

2017-01-01T00:00:00Z

The Association of Epstein –Barr Virus Infection with Progress of Cancer and Immune Defects SABER, Soran Shareef ABSTRACT: Epstein-Barr virus was the first human virus to be directly implicated in carcinogenesis. It infects more than 90% of the world’s human population. EBV is a member of the herpes virus family. EBV infection forms both a lytic or long-term latent infection. EBV escapes from immunologic mechanism with infection of B-lymphocytes and control different signaling pathways. The important data on prognosis EBV expansion is immune cells response, especially natural killer (NK) cells. The aim of this study is an elucidation of molecular mechanisms that induce the disturbance of immune response and cancerogenesis.The study to establish relation between the association of Epstein-Barr virus infection and the progress of cancer and immune defects performed with using the samples of blood patients. The samples were collected in the Hiwa hospital specialized for cancer disease in Sulaymaniyah city during the period from springtime-summer 2016. Thirty samples of lymphocytes and monocytes were collected from blood of patients with nasopharyngeal carcinoma, gastric carcinoma and breast cancer. Ten subjects that were age and gender matched with study groups as healthy control were used. Both standard PCR and Real-time PCR (RT-PCR) were used to detect presence of EBV and checked EBV-encoded noncoding RNA as a functional backup of viral oncogene depending on conventional method. Western blot method was used for determination antibody against CD56 and complete blood count (CBC) for disorder characteristics. Obtained with PCR analyses results shown that more than 90% of the individuals were identified as a positive result of EBV infection. Moreover, these results demonstrated that positivity of Latent infection gene (EBER-2) oncogene in nasopharyngeal carcinoma (60%), gastric carcinoma (50%) and breast cancer (35%) in patients respectively. The results western blot shown the increasing of CD56 content in leukocytes of the patient groups have breast cancer (82%), gastric carcinoma (45%) and nasopharyngeal carcinoma (39%) compared with control samples. The analysis of blood cells evident that more than 80% of the patients have a decrease for next CBC parameters HGB (26%), WBC (15%), MPV (10%), Lymphocytes (50%) and Granulocytes (20%) related with control. Presented results let assume the association between EBV infection and cancer genesis for distinct types of cancer, especially, for studied samples of nasopharyngeal carcinoma and gastric carcinoma. There determined for both carcinomas about 50% and more positive results for EBER-2 oncogene in studied cohort of patients.; ÖZET: Epstein-Barr (EBV) virüsü doğrudan karsinogenezle ilişkilendirilen ilk insan virüsüdür. Dünyada insan populasyonunun % 90’ını enfekte eden bir virüstür. EBV herpes virus ailesindendir. EBV infeksiyonları hem litik hem de uzun süren latent enfeksiyon oluşturmaktadır. EBV virüsü B lenfositlerin dahil olduğu bağışıklık mekanizmasından kaçar ve sinyal yolağını kontrol eder. EBV yayılması ile alakalı önemli bir teşhis bağışıklık hücrelerinin özellikle doğal öldürücü hücrelerinin reaksiyon göstermesidir. Bu çalışmanın amacı bağışıklık tepkisinin bozulmasını arttıran moleküler mekanizmaların karsinojenezle arasındaki ilişkiyi ortaya çıkarmaktır. Bu çalışmada EBV infeksiyonu ile kanser gelişimi ve bağışıklık sorunları arasındaki ilişkiyi belirlemek için hastalardan alınan kan örnekleri kullanılmıştır. Örnekler Süleymani şehrinde yaşayan kanser hastalarından Hiwa hastanesinden toplanmıştır. Nazofarinks, gastric ve göğüs kanseri hastalarından toplamda otuz tane limfosit ve monosit örnekleri elde edilmiştir. Sağlıklı bireylerden alınan örnekler kontrol olarak kullanılmıştır. EBV ve checked EBV- encoded kodlama yapmayan RNA varlığını belirlemek için standart PCR ve real-time PCR (RT-PCR) yöntemleri kullanılmıştır. Western blotlama ile CD56 ekspresyonunu ve tüm kan sayımını göstermek için CD56 antikoru kullanılmıştır. PCR analiz sonuçları ile elde edilen sonuçlar, bireylerin %90'dan fazlasının EBV enfeksiyonu açısından pozitif olduğunu göstermiştir. Üstelik bu sonuçlar, hastalarda nazofaringal karsinom (%60), gastrik karsinom (%50) ve meme kanserinde (%35) latent enfeksiyon onkogeninin (EBER-2) pozitifliğinin sırasıyla gösterildiğini ortaya koymuştur. Western blotlama sonuçları, hasta gruplarının lökositlerindeki CD56 içeriğinin artmasının, kontrol numunelerine kıyasla meme kanseri (%82), nazofaringal karsinom (%39) ve gastrik karsinomanın (%45) var olduğunu gösterdi. HBC (%26), WBC (%15), MPV (%10), lenfositler (%50) ve Granülositler (%20) ile hastaların %80'den fazlasının bir sonraki Tam kan sayımı parametrelerinde azalma olduğunu gösteren kan hücrelerinin analizi Elde edilen sonuçlar, EBV enfeksiyonu ile kanserojenez arasında, özellikle de nazofarengeal karsinom ve gastrik karsinomun incelenen örnekleri için farklı kanser tipleri arasında ilişki olduğunu gösterdi. Çalışılan hasta grublarında EBER-2 onkogeninde her iki karsinoma türünde de (%50) oranında daha fazla pozitif sonuç elde edildi.

Determination of Serum Fatty Acids Profile in Patients Undergoing Myocard Infarct in Erbil

2017-01-01T00:00:00Z

Determination of Serum Fatty Acids Profile in Patients Undergoing Myocard Infarct in Erbil ISMAEL, Saman Tawfeeq ABSTRACT: In this master's thesis study, fatty acids profile, lipid profile, and cardiac biochemical's were studied in myocardial infarction and compared with healthy individuals at Erbil province in Iraq. First about cardiac biochemical's shows the mean S. troponin and CK-MB levels in the normal and MI groups. The results obtained indicate that the mean level of S. troponin and CK-MB in MI group were significantly very higher than that of control group (p<0.0001). Then about fatty acid composition provides the Mean ± SD, of each of the total saturated, monounsaturated and poly unsaturated fatty acids in control and MI groups, the results obtained that the mean of S. total saturated fatty acids in MI group was non-significantly higher than that of control group, S. total monounsaturated fatty acids in MI significantly (P<0.05) lower than that of control group, and S. total polyunsaturated fatty acids in MI group significantly (P<0.001) lower than that of control group. Finally, the Mean ± SD, of each of the lipid profile, indicated that each of S. triglycerides and S. total cholesterol in MI were significantly higher than that of controls (P<0.001), S.LDL in MI group was significantly higher than that of controls (P<0.0001), while S.HDL in MI group was significantly lower than that of control group (P<0.001).; ÖZET: Bu yüksek lisans tez çalışmasında Irak’ın Erbil şehrinde miyokard enfarktüsü geçiren hastalarda yağ asidi profili, lipid profili ve kardiyak biyokimyasal değerler çalışıldı ve sağlıklı bireylerle karşılaştırıldı. Önce kardiyak biyokimyasal veriler normal ve MI gruplarında S. troponin ve CK-MB düzeylerini göstermektedir. Elde edilen sonuçlar, MI grubunda ortalama S. troponin ve CK-MB seviyesinin kontrol grubuna göre anlamlı derecede yüksek olduğunu göstermektedir (p <0,0001). Daha sonra, yağ asidi bileşimi, kontrol ve MI gruplarındaki toplam doymuş, tekli doymamış ve poli doymamış yağ asitlerinin ortalama ± SD'sini sağlar; elde edilen sonuçlar, MI grubundaki toplam S. doymuş yağ asitlerinin ortalamasının, MI grubundaki ortalama doymamış yağ asitlerinin ortalamasının, kontrol grubuna göre S. toplam mono-doymamış yağ asitleri, kontrol grubuna göre anlamlı derecede düşük (P <0,05) ve MI grubunda S. çoklu doymamış yağ asitleri kontrol grubuna göre anlamlı olarak düşük (P <0,001) bulundu. Son olarak, her bir lipid profilinin ortalama ± SD, MI'daki S. trigliseridlerin ve S. total kolesterolün, MI grubundaki kontrollerden daha yüksekti (P <0,001), S.LDL'nin MI grubunda anlamlı olarak daha yüksek olduğunu gösterdi (P <0,0001), MI grubundaki S.HDL ise kontrol grubuna göre anlamlı olarak daha düşüktü (P <0,001).