Biology https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/1360 2026-10-12T12:24:28Z 2026-10-12T12:24:28Z ÖZCAN, Seher https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6399 2026-10-12T12:21:34Z 2019-01-01T00:00:00Z

Hydrophilinae (Coleoptera: Hydrophilidae) Alt Familyasına Ait Bazı Böcek Türlerinden Elde Edilecek Protein Ekstraktlarının Anti Kanser Özelliklerinin Belirlenmesi ÖZCAN, Seher ÖZET Bu çalışmada hydrophilinae (Coleoptera: Hydrophilidae) Alt Familyasının Hydrochara dichroma ve Hydrophilus piceus türlerinin protein özütlerinin elde edilmesi yolunda hareket edilmiştir. Elde edilen Protein miktarları Bradford yöntemi ile hesaplanmış ve Hydrochara dichroma türünün absorbans değeri 0,4144 mg iken, Hydrophilus piceus türünün ise absorbans değeri 0,3411mg. olarak belirlenmiştir. Hazırlanan bu örnekler hücre kültürüne alınarak prostat kanser hattı hücrelerinde (PC3) WST-1 ile hücre canlılık testi yapılmıştır. Test sonucu incelendiğinde çalışılan iki tür içinde protein ekstrelerinin hücre inhibisyonun’da düşmeye sebebiyet verdiği gözlemlenmiştir. En yüksek hücre inhibisyonu 1000 mg/ml böcek protein ekstraktı eklenmiş örneklerde gözlemlenmiştir. Daha sonra etkin doz bulunmuş olup western blot tekniği ile protein ürünlerine bakılmıştır. Bu çalışmanın sonucu olarak diyebiliriz ki western blot tekniğinde böcek proteinlerinin hücre ölümünü sağlayacak olan proteinlerin üretimini desteklediği görülmüştür.; ABSTRACT: In this study, we aimed to obtain protein extracts of Hydrochara dichroma and Hydrophilus piceus from HYDROPHİLİNAE (COLEOPTERA: Hydrophilidae). The amount of protein obtained was calculated by Bradford method and the absorbance value of Hydrochara dichroma was 0.4144 mg, while the absorbance value of Hydrophilus piceus was 0.3411mg. as determined. Cell viability test was performed with WST-1 in prostate cancer line cells (PC3). When the test result was examined, it was observed that protein extracts caused decrease in cell inhibition in the two species studied. The highest cell inhibition was observed in samples with 1000 mg / ml insect protein extract added. Then the effective dose was found and protein products were examined by western blot technique. As a result of this study, we can say that the western blot technique has been shown to support the production of insect proteins that will enable cell death.

2019-01-01T00:00:00Z SABER, Soran Shareef https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6397 2026-10-12T11:54:45Z 2017-01-01T00:00:00Z

The Association of Epstein –Barr Virus Infection with Progress of Cancer and Immune Defects SABER, Soran Shareef ABSTRACT: Epstein-Barr virus was the first human virus to be directly implicated in carcinogenesis. It infects more than 90% of the world’s human population. EBV is a member of the herpes virus family. EBV infection forms both a lytic or long-term latent infection. EBV escapes from immunologic mechanism with infection of B-lymphocytes and control different signaling pathways. The important data on prognosis EBV expansion is immune cells response, especially natural killer (NK) cells. The aim of this study is an elucidation of molecular mechanisms that induce the disturbance of immune response and cancerogenesis.The study to establish relation between the association of Epstein-Barr virus infection and the progress of cancer and immune defects performed with using the samples of blood patients. The samples were collected in the Hiwa hospital specialized for cancer disease in Sulaymaniyah city during the period from springtime-summer 2016. Thirty samples of lymphocytes and monocytes were collected from blood of patients with nasopharyngeal carcinoma, gastric carcinoma and breast cancer. Ten subjects that were age and gender matched with study groups as healthy control were used. Both standard PCR and Real-time PCR (RT-PCR) were used to detect presence of EBV and checked EBV-encoded noncoding RNA as a functional backup of viral oncogene depending on conventional method. Western blot method was used for determination antibody against CD56 and complete blood count (CBC) for disorder characteristics. Obtained with PCR analyses results shown that more than 90% of the individuals were identified as a positive result of EBV infection. Moreover, these results demonstrated that positivity of Latent infection gene (EBER-2) oncogene in nasopharyngeal carcinoma (60%), gastric carcinoma (50%) and breast cancer (35%) in patients respectively. The results western blot shown the increasing of CD56 content in leukocytes of the patient groups have breast cancer (82%), gastric carcinoma (45%) and nasopharyngeal carcinoma (39%) compared with control samples. The analysis of blood cells evident that more than 80% of the patients have a decrease for next CBC parameters HGB (26%), WBC (15%), MPV (10%), Lymphocytes (50%) and Granulocytes (20%) related with control. Presented results let assume the association between EBV infection and cancer genesis for distinct types of cancer, especially, for studied samples of nasopharyngeal carcinoma and gastric carcinoma. There determined for both carcinomas about 50% and more positive results for EBER-2 oncogene in studied cohort of patients.; ÖZET: Epstein-Barr (EBV) virüsü doğrudan karsinogenezle ilişkilendirilen ilk insan virüsüdür. Dünyada insan populasyonunun % 90’ını enfekte eden bir virüstür. EBV herpes virus ailesindendir. EBV infeksiyonları hem litik hem de uzun süren latent enfeksiyon oluşturmaktadır. EBV virüsü B lenfositlerin dahil olduğu bağışıklık mekanizmasından kaçar ve sinyal yolağını kontrol eder. EBV yayılması ile alakalı önemli bir teşhis bağışıklık hücrelerinin özellikle doğal öldürücü hücrelerinin reaksiyon göstermesidir. Bu çalışmanın amacı bağışıklık tepkisinin bozulmasını arttıran moleküler mekanizmaların karsinojenezle arasındaki ilişkiyi ortaya çıkarmaktır. Bu çalışmada EBV infeksiyonu ile kanser gelişimi ve bağışıklık sorunları arasındaki ilişkiyi belirlemek için hastalardan alınan kan örnekleri kullanılmıştır. Örnekler Süleymani şehrinde yaşayan kanser hastalarından Hiwa hastanesinden toplanmıştır. Nazofarinks, gastric ve göğüs kanseri hastalarından toplamda otuz tane limfosit ve monosit örnekleri elde edilmiştir. Sağlıklı bireylerden alınan örnekler kontrol olarak kullanılmıştır. EBV ve checked EBV- encoded kodlama yapmayan RNA varlığını belirlemek için standart PCR ve real-time PCR (RT-PCR) yöntemleri kullanılmıştır. Western blotlama ile CD56 ekspresyonunu ve tüm kan sayımını göstermek için CD56 antikoru kullanılmıştır. PCR analiz sonuçları ile elde edilen sonuçlar, bireylerin %90'dan fazlasının EBV enfeksiyonu açısından pozitif olduğunu göstermiştir. Üstelik bu sonuçlar, hastalarda nazofaringal karsinom (%60), gastrik karsinom (%50) ve meme kanserinde (%35) latent enfeksiyon onkogeninin (EBER-2) pozitifliğinin sırasıyla gösterildiğini ortaya koymuştur. Western blotlama sonuçları, hasta gruplarının lökositlerindeki CD56 içeriğinin artmasının, kontrol numunelerine kıyasla meme kanseri (%82), nazofaringal karsinom (%39) ve gastrik karsinomanın (%45) var olduğunu gösterdi. HBC (%26), WBC (%15), MPV (%10), lenfositler (%50) ve Granülositler (%20) ile hastaların %80'den fazlasının bir sonraki Tam kan sayımı parametrelerinde azalma olduğunu gösteren kan hücrelerinin analizi Elde edilen sonuçlar, EBV enfeksiyonu ile kanserojenez arasında, özellikle de nazofarengeal karsinom ve gastrik karsinomun incelenen örnekleri için farklı kanser tipleri arasında ilişki olduğunu gösterdi. Çalışılan hasta grublarında EBER-2 onkogeninde her iki karsinoma türünde de (%50) oranında daha fazla pozitif sonuç elde edildi.

2017-01-01T00:00:00Z AŞKAN, Ronahi https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6389 2026-09-30T09:18:46Z 2023-01-01T00:00:00Z

Aurora B Kinaz İnhibitörü BI 831266 Molekülünün Sisplatin Tedavisinin Sitotoksik Potansiyeli Üzerine Olan Etkisinin Belirlenmesi AŞKAN, Ronahi ÖZET: Kanser, proteinlerin işlevsizliği nedeniyle hücrelerin kontrolsüz bir şekilde çoğalması sonucunda vücutta meydana gelen tedavi edilmesi zor bir hastalıktır. Kanser tedavisinde kullanılan konvansiyonel yöntemler başarılı sonuçlar sağlasa da bu tedaviler hastalar üzerinde ciddi yan etkilere ve bir süre sonra hücrelerin bu tedavilere direnç geliştirmesine neden olmaktadır. Bu önemli nedenlerden dolayı kişiselleştirilmiş tedaviler oldukça önem arz etmektedir. Kemoterapide hali hazırda kullanılan ilaçlarla küçük molekül inhibitörlerin kombinasyon tedavileri sinerjistik etki yaratarak bu olumsuz etkileri ortadan kaldırmak için önemli rol oynamakta ve küçük molekül inhibitörleri önemli kılmaktadır. Bu çalışmada, hücre döngüsünün önemli bir regülatörü olan Aurora B kinaz inhibisyonunun konvansiyonel anti-kanser tedavisinde başarılı bir şekilde kullanılan sisplatinin sitotoksisitesi üzerine olan etkisi araştırıldı. Aurora B inhibisyonu için daha önce üzerine herhangi bir kombine sitotoksik analiz yapılmamış olan BI 831266 molekülü kullanıldı. Sisplatin ve BI 831266 molekülünün mono ve kombine tedavi sitotoksik etkileri insan meme kanseri hücrelerinde (MCF-7) incelendi. MCF-7 hücreleri artan dozlarda sisplatin ve BI 831266 molekülü ile tedavi edildi ve sitotoksik etki koloni sağ-kalım analiziyle belirlendi. IC50 dozları belirlenen sisplatin ve BI 831266 molekülünün sinerjistik etkisi kombine tedavi ile belirlendi. Sisplatin ve BI 831266 molekülünün kombinasyon tedavisi, koloni sağ-kalım analizi ile kanser hücrelerinin koloni oluşma kapasitelerini inhibe ettiği gösterildi. Sisplatin ve BI 831266 molekülünün mono ve kombinasyon tedavileri MCF-7 hücrelerinde DNA hasarı ve apoptotik sinyal yolaklarındaki proteinlerin ekspresyon düzeylerine western blot yöntemiyle bakıldı. Bu çalışmada elde edilen veriler, sisplatin ve BI 831266 molekülünün kombinasyon tedavileri hücre canlılığını azalttığı ve koloni sağ-kalımlarını baskıladığı, apoptozisle ilişkili proteinlerin ekspresyon seviyelerini regüle ederek DNA hasarına ve apoptoza sebep olduğunu göstermektedir.; ABSTRACT: Cancer is a difficult to treat disease that occurs in the body as a result of the uncontrolled proliferation of cells due to the dysfunction of proteins. Although conventional methods used in cancer treatment provide successful results, these treatments cause serious side effects on patients and after a while, the cells develop resistance to these treatments. For these important reasons, personalized treatments are very important. Combination treatments of drugs currently used in chemotherapy and small molecule inhibitors play an important role in eliminating these negative effects by creating a synergistic effect, making small molecule inhibitors important. In this study, the effect of inhibition of Aurora B kinase, an important regulator of the cell cycle, on the cytotoxicity of cisplatin, which has been used successfully in conventional anti-cancer therapy, was investigated. For Aurora B inhibition, BI 831266 molecule, on which no combined cytotoxic analysis was performed before, was used. The mono- and combined-therapy cytotoxic effects of cisplatin and BI 831266 were investigated in human breast cancer cells (MCF-7). MCF-7 cells were treated with increasing doses of cisplatin and the BI 831266 molecule, and the cytotoxic effect was determined by colony survival analysis. The synergistic effect of cisplatin and BI 831266 molecule, whose IC50 doses were determined, was determined by combined treatment. Combination treatment of cisplatin and BI 831266 molecule was shown to inhibit colony formation capacity of cancer cells by colony survival assay. Mono and combination treatments of cisplatin and BI 831266 molecule DNA damage and expression levels of proteins in apoptotic signaling pathways in MCF-7 cells were evaluated by western blot method. The data obtained in this study show that combination treatments of cisplatin and BI 831266 molecule reduce cell viability and suppress colony survival, and cause DNA damage and apoptosis by regulating the expression levels of apoptosis-related proteins.

2023-01-01T00:00:00Z ABDALLA, Othman Rasw https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6379 2026-09-25T11:25:20Z 2018-01-01T00:00:00Z

The Effect of Curcumin on P53 /TIGAR and Autophagy Pathway in Human Osteosarcoma U2OS Cell Line ABDALLA, Othman Rasw ABSTRACT: Osteosarcoma is a cancer disease from primitive bone tumor initiation and evolution of tubular long bones include femur, humerus and tibia. Osteosarcoma disease is defined and diagnosed throughout the inspection of tumor osteoblast cells that produce osteoid. Turmeric (Curcuma longa) is the most effective component in dried ground rhizomes of a member Zingiberaceae family. Curcumin have excellent free radical scavenging properties, however curcumin is almost the strongest antioxidant present in turmeric. Turmeric seasonal herbaceous plant with long lateral ramifications originally comes from Southeast Asia. Curcumin properties include anticancer, anti-bacterial, anti-inflammatory and antioxidant. Curcumin as chemical therapeutic agent demonstrated to suppress or inhibit various signaling pathways includes arrest tumor cell proliferation, inducing autophagy or apoptosis, inhibit malignant cell invasion and suppressing inflammatory responses. Despite the fact that effects of curcumin in cancer has been broadly reported, but the weather of curcumin on p53/TIGAR and autophagy has not been addressed in osteosarcoma U2OS cell line. In this present study, we screened the weather of curcumin after treated U2OS cells with curcumin, cultured cell were treated by various concentrations (10, 15, 20 and 25) μMolars curcumin intended for 24h. After cultured and treatment cells proliferation and viability were detected by MTT assay. The expression levels of these proteins (p53, TIGAR, Beclin-1 and LC3) were analyzed by immunoblotting assay and the expression of LC3 protein autophagy marker were analyzed by immunocytochemistry assay. The MTT assay results demonstrated that curcumin lead to distinct suppression of osteosarcoma cell proliferation and cell viability. There were observed a linear dose/depends effect for curcumin range 15-25 μM dose cause to modulate of p53, TIGAR, Beclin1 and LC3. Analysed protein reveals a relation reduction in the levels of p53 and TIGAR proteins above treatment with 10–25 μM curcumin. The result of immunocytochemistry showed that by increasing curcumin dose significantly increased the expression of the total amount LC3 protein in cytoplasm osteosarcoma U2OS cells. Our studied has improved the perceptive of the fundamental technique anticancer properties of curcumin.; ÖZET: Osteosarkom, kemiklerde en sık rastlanan primer tümörlerdir ve genellikle tibia, femur, humerus gibi uzun boru şekilli kemiklerin metafizi çevresinde ortaya çıkar. Curcumin, Curcuma longa L'nin kurutulmuş toprak rizomlarındaki en önemli etkiye sahip bileşendir. Yara iyileşmesini destekler, karaciğer hasarına, katarakt oluşumuna ve pulmoner toksisiteye karşı koruma sağlar. Curcumin (zerdeçal) geleneksel Çin tıbbında binlerce yıldır kullanılmaktadır. Anti-bakteriyel, anti-inflamatuvar, anti-oksidan ve anti-kanser özellikleri de dahil olmak üzere birçok farmakolojik etkiue sahip olduğu bildirilmiştir. Curcumin’in, hücre invazyonunu engellemek, migrasyonu ve inflamatuar yanıtları bastırmak, apoptoz veya otofajiyi tetiklemek birçok etkisinin olduğu kanıtlanmıştır. Kansere karşı curcumin etkilerinin kapsamlı bir şekilde araştırılmış olmasına rağmen curcumin'in p53 / TIGAR ve otofajik yolak üzerindeki etkisi U2OS hücre hattında henüz ele alınmamıştır. Bu nedenle insan osteosarkom U2OS hücre hattında curcuminin p53 / TIGAR ve otofaji yolu üzerindeki etkisininin araştırılması amaçlanmıştır. Osteosarkom U2OS hücreleri 24 saat süreyle farklı konsantrasyonlarda (10, 15, 20 ve 25 μM) curcumin ile tedavi edildi. Hücre çoğalması hücre canlılık testi olan MTT ile saptanmıştır. Bu proteinlerin (p53, TIGAR, Beclin-1 ve LC3) ekspresyon seviyeleri, western blotting ile analiz edilmiştir. MTT analizinin sonuçları, curcumin'in osteosarkom hücre proliferasyonunun ve hücre canlılığının inhibisyonuna neden olduğunu göstermiştir. Curcumin aralığı 15-25 μM doz ve p53, TIGAR, Beclin1 ve LC3 modülasyonu için doza / bağımlı doğrusal bir etkisinin olduğu belirlenmiştir. Osteosarkom U2OS hücre hattı 15-25 uM curcumin ile tedavi edildiğinde p53 ve TIGAR protein seviyelerinde bir düşüş olduğu ortaya konmuştur. Beclin-1'in curcumin tarafından inhibe edilmesi otofajiye spesifik belirteç olan mikrotübüle bağlı protein LC3’nin artmasına yol açmaktadır. Immünositokimya sonucunda curcumin dozunun artmasıyla total LC3 proteininin ekspresyonunun belirgin şekilde arttığı gösterilmiştir. Bu bulgular, curcumin'in antikanser özelliklerinin altında yatan mekanizmanın anlaşılmasını geliştirmiştir.

2018-01-01T00:00:00Z