DNA dizilimlerindeki protein kod bölgelerinin tanımlanması için fourier tabanlı filtreleme yaklaşımı

Abstract

Genomik araştırmalarda protein kod bölgelerinin belirlenmesi çok zordur. Üç baz periyotuna sahip bu kod bölgeleri ekson olarak ta adlandırılır. Bu makalenin amacı, bir DNA dizilimindeki eksonların pozisyonlarını Fourier tabanlı filtreleme yaklaşımı kullanarak tahmin etmektir. Bu amaç doğrultusunda insan türünün M8694 genine ait DNA dizilimleri EIIP haritalama tekniği ile sayısal diziye dönüştürülmüştür. Sayısallaştırılmış DNA dizilimlerinin zaman frekans domeni Fourier yöntemi ile elde edilmiş ve antinotch filtresi kullanılarak 3 periyotlu sinyal filtrelenmiştir. Filtrelenmiş sinyalin ekson bölgeleri belirlenen persentil eşik değerine göre başarılı bir şekilde tanımlanmıştır.