https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/1357 Institute of Sciences Fri, 10 Jul 2026 15:30:31 GMT 2026-07-10T15:30:31Z https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6204 Selective Isolation, Identification and Molecular Characterization of Streptomyces Species From Soil of Sulaimani Province, North of Iraq QADIR, Miran Hussein ABSTRACT: In this study, a total 32 soil samples collected from Pshdar and Ranya sites which are districts in Sulaimani governorate, Kurdistan Region of Iraq. The samples were subject to isolation of actinomycetes genera and streptomyces bacteria. Initially, physicochemical parameters of soil samples were measured and then selective media raffinose-histidine agar supplemented with cycloheximide and nystatin, and starch-casein agar plates supplemented with same antifungal antibiotics and novobiocin, were used to isolate Streptomyces strains from soil samples. In total, 164 streptomycetes were isolated from the soil samples and were de-replicated manually based on: aerial spore mass, colony reverse and diffusible pigment colours formed on oatmeal agar, and their capacity to produce melanin pigments on peptone yeast extract iron agar. Using numerical analysis method, 40 diagnostic tests were carried out on 20 representative test strains of the colour groups; the samples were assigned into 10 clusters. In general, the clusters of isolates delineated in the dendrogram generated using the distances were found to match those obtained by manual colour-grouping of the isolates. The implications of the computer-assisted colour-grouping method for ecological studies are important. For phylogenetic analysis, 16S rDNA genes of 20 test strains were amplified with 2 universal primers after extraction of genomic DNA and then sequenced; however, only 18 of them were successfully sequenced. These representative 18 test strains were subject to phylogenetic analysis of DNA sequence of 16S rDNA and 11 out of 18 test strains were identified as Streptomyces species while 3 of them identified as Amycolatopsis species; they were Amycolatopsis umgeniensis UM16 and Amycolatopsis xuchangensis CFH S0322. Two test strains were identified as Nocardia species and they were Nocardia ignorata DSM 44496 and Nocardia rhamnosiphila NRRL B-24637. The other two test strains were identified as Lentzea flaviverrucosa AS4.0578 species. Out of the 11 strptomyces; 4 were S. anulatus, 4 were S. fulvissimus, 2 were S. lateritius, and 1 was S. atrovirens. A reasonable linear correlation was found between the colour-group, and corresponding dendogram that was generated after analysis of base sequence of 16S rDNA genes. Also, chemotaxonomic studies, sugar analysis and diaminopimelic acid (DAP) analysis, on 4 test strains of representatives from phylogenetic dendogram were more or less in agreement with the result of phylogenetic analysis and numerical analysis of test strains, and these are supported by previous studies. The data indicates that the K02008 (13K) and K20134 (4K) which were isolated should be recognized as new species in the genus Amycolatopsis, because they are 99,15% similar to Amycolatopsis xuchangensis CFH S0322(T). Also, K18126 (6K), and K21147 (16K) that were isolated should be recognized as new species in the genus Lentzea, since they are 99,15% similar to Lentzea flaviverrucosa AS4.0578(T). However, all these new isolated species mentioned should be further studies using DNA-DNA hybridization of the strains with nearest type strain.; ÖZET: Bu çalışmada, Irak’ın Süleymaniye vilayetinin Pshdar ve Ranye bölgesinde toplanan 32 toprak numunesinden actinomycetes cinsleri ve Streptomyces cinsine ait bakteriler izole etmek amaçlandı. Başlangıçta toprak numunelerinin fizikokimyasal parametreleri ölçüldü ve ondan sonra Streptomyces suşlarını izole etmek için içerisine cycloheximide ve nystatine içeren nişasta-kazein agar ve yine içerisine cycloheximide, nystatine ve novobiocin antibiyotikleri eklenmiş raffinoz-histidin agar içeren petri kutularına ekim yapıldı. Toprak numunelerinde izole edilen toplam 164 Streptomyces suşu oatmeal agar besiyerinde havasal ve substrat miselyum spor renkleri, diffüziye pigment rengi ve ayrıca pepton-yeast agar besi ortamında melanın pigment üretimi dikate alınarak gruplandırdı. Renk gruplarını temsilen seçilen 20 test suşu 40 diagnostik teste tabi tutuldu ve sonuçlar numerik analizi yapıldı ve test suşları 10 gruba ayrıldı. Renk grupları ile numerik analiz gruplarının içerdiği suşlar genelde uygunluk gösterdi. Bilgisayara dayalı renk gruplandırma analizleri hem ekolojik hemde biyolojik ürün araştırmalarında ön çalışma olarak önemlidir. Test suşlarının filogenetik analizleri için 20’inin 16S rDNA genleri DNA ekstraksiyonundan sonra evrensel primerler kullanılarak 16S rDNA genleri çoğaltıldı ve 18’inin nükleotid zinciri belirlendi. Bu 18 suşun 16S rDNA genleri filogenetik analizi yapıldı ve 11’i Streptomyces türü olaral teşhis edilirken 3’ü Amycolatopsis umgeniensis UM16 ve Amycolatopsis xuchangensis CFH S0322. türü olarak teşhis edildi. 3’ü ise Nocardia ignorata DSM 44496 ve Nocardia rhamnosiphila NRRL B-24637 ve 1’i Lentzea flaviverrucosa AS4.0578 türü olarak teşhis edildi. 11 Streptomyces türlerinden 4’ü S. Anulatus, 4’ü S. fulvissimus, 2’si S. lateritius LMG 19372 ve 1’i S. atrovirens türü olarak teşhis edildi. 16S rDNA genlerinin analiz sonucu oluşan dendogramdaki gruplar ile renk gruplandırması arasında korelasyon görüldü. Yine filogenetik analiz sonucu oluşan dendogramdan seçilen 4 suşun tüm hücre şeker analizi ve diaminopimelik asit (DAP) gibi kemotaksonomik sonuçları numerik analiz ve filogenetik analiz sonuçları uygunluk gösterdi ve önceki sonuçları destekledi. Bu veriler K02008 (13K) and K20134 (4K) suşunun Amycolatopsis xuchangensis CFH S0322 %99,15 oranında benzerlik gösterdiğinden yeni tür olarak kabul edimesi gerekir. Fakat DNA-DNA hibdridisazyon çalışması en yakın tip suşla yapılması gerekir. Yine kemotaksonomik çalışmalar için filogenetik analiz sonucu 4 test suşu seçildi, şeker analizi ve diaminopimelik asit (DAP) analizi yapıldı. Sonuçlar numerik ve filogenetik analiz sonuçlari ile uyum gösterdi ve önceki çalışmalar ile desteklendi. Verilerimiz K02008 (13K) ve K20134 (4K) Amycolatopsis xuchangensis CFH S0322. türüne % 99.15 benzerliğinden dolayı yeni tür olabilir. Yine K18126 (6K) ve K21147 (16K) suşlarıda Lentzea flaviverrucosa AS40578 ile %99.15 benzerliğinden dolayı yeni tür olması muhtemeldir. Bunun ile birlikte bütün izole edilen türlerin yeni tür olduğunu ispatlamak için en yakın tip suşu ile DNA-DNA hibridizasyon çalışması yapılması gerekir. Sun, 01 Jan 2017 00:00:00 GMT https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6204 2017-01-01T00:00:00Z https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6203 Change Detection Analysis of Dukan Dam Surface Area From (2000-2016) in Sulaimaniyah, Iraq, Using Remote Sensing and GIS RASHID, Safin Najib ABSTRACT: This research examines the changes in land use/land cover and change detection of surface water in Dukan dam in Sulaimaniyah north of Iraq, The primary aim of this study is to use Landsat 7 ETM and Landsat 8 OLI imagery with Remote sensing techniques to study and investigate the change of surface water for two years periods. Two Landsat 7 ETM and 8 OLI images were obtained in Nov 2000, and Nov 2016. Land use categories were derived using supervised classification techniques with maximum likelihood algorithm and change detection to surface water body. The change detection results there is a significant change in the quantity of water body between 2000-2016, and indicate that there is a growing trend toward water in year 2016 at the expense of agricultural land, vegetation land and barren land. The quantity of water was (92.94) km sq, with ratio (17.62%) in 2000 increased to (186.42) km sq, in ratio (30.12%) in 2016, these because years around 2000 precipitations was low (380.4) mm because drought happened and water body decreased. The specific reasons of increasing water body in 2016 are the years after 2000 the rate of rainfall was high (816.8) mm. Increasing the rate of water constantly because of feeding from other water resources and melting snow from the mountains around Dukan dam along the years after 2000. In this study water body and the changing, it is focused on more than the other class. The result of the classification showed that Barren land was 214.36 km sq, with ratio 24.36% in 2000 decreased to 121.59 km sq, in ratio 13.36% in 2016. Agricultural land was 441.76 km sq, with ratio 47.51% in 2000 decreased to 372.94 km sq, in ratio 37.59% in 2016 because of increasing water. Built up areas are mild increased because of increasing population and coming people from the villages to the area that was 11.22 km sq, with ratio 0.94% in 2000 increased to 25.4 km sq, in ratio 4.13% in 2016. And there is a mild increase in vegetation. Conclusively, remote sensing and GIS proved to be very effective in studying and monitoring the relationship between change detection for water body and LULCC.; ÖZET: Bu araştırmanın amacı Irak'ın kuzeyinde Süleymaniye'deki Dukan Barajı'ndaki arazi kullanım / arazi örtüsü ve yüzey sularının değişiminde meydana gelen değişiklikleri incelemektedir. Bunla birlikte bu çalışma ile, Uzaktan Algılama Teknikleri ile Landsat 7ETM ve Landsat 8OLI görüntülerinin incelenmesi ve Yüzey suyunun iki yıl boyunca değişimi araştırılmıştır. Bu bağlamda Kasım 2000 ve Kasım 2016'daki iki Landsat 7ETM ve 8OLI görüntüsü elde edilmiştir. Çalışmada arazi kullanım kategorileri, maksimum olasılık algoritması ve yüzey suyu kütlesine değişim algılama ile denetlenen sınıflandırma teknikleri kullanılarak türetilmiştir. Çalışmada belirlenen değişiklik sonuçlarına göre, 2000 ile 2016 yılları arasında su yüzel alanı oranında önemli bir değişiklik olduğunu ve 2016 yılında tarım arazisi, vejetasyon arazisi ve çorak arazi miktarında suya doğru artan bir eğilim olduğunu göstermiştir. Su oranı %17,62'den %30,12'ye ve alan miktarıda 92,94 km2 den 186,42 km2’ye artmıştır. 2000 yılı civarında yağış oranındaki azalma ile bu bölgede kuraklık olmuş ve buda su yüzey alanının azalmasının özel bir nedeni olmuştur. 2016'da su yüzey alanının artmasının spesifik nedenleri, 2000 yılından sonraki yılların ardından, diğer su kaynaklarından gelen suyun Dukan barajına girmesi ve dağlardan Dukan barajı çevresindeki suyun erimesiyle birlikte sürekli olarak suyun hızını arttıran yağış oranının yüksek olmasıdır Bu çalışmada su yüzey alanı ve değişimine, diğer sınıflardan daha fazla odaklanmıştır. Sınıflama çalışmaları sonucu çorak arazilerin 2016 yılında çok azaldığını göstermiştir. Bir başka ifadeyle 214,36 km2’ den 2000 121,59 km2 azalmıştır 2016. Suyalanının artması nedeniyle tarımsal alanlar, Bir başka ifade ile tarım alanları 441.76 km2 den 372,94 km2 ye azalmıştır. Araştırma alanındaki yapılaşma alanında az bir artış görülmüştür. Başka bir ifade ile yapılaşma alanı 11,22 km2 den 25,4 km2 ye artmıştır. Araştırma alanındaki bitki örtüsü yüzey alanı yüzde olarak %9,12’den %13,16 oranına az bir artış göstermiştir. Alan cinsinden ise bu değer 31,54 km2 den 85,12 km2 ye artmıştır. Bitki örtüsü hafif artışı. Sonuç olarak, uzaktan algılama ve CBS tekniklerinin, su yüzey alanı ve LULCC için değişim aralıkları arasındaki ilişkiyi incelemekte ve izlemekte çok etkili olduğu kanıtlanmıştır. Sun, 01 Jan 2017 00:00:00 GMT https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6203 2017-01-01T00:00:00Z https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6201 Bingöl İli Lediz, Vahkin-Çanakçı, Göynük ve Çapakçur Mikrohavza Projelerinden Yöre Halkının Memnuniyet Düzeyinin Belirlenmesi BİLİNMİŞ, Mehmet Murat ÖZET: Bu araştırma ile Bingöl ili Lediz, Vahkin-Çanakçı, Göynük ve Çapakçur mikrohavzalarında uygulanan projelerden bu bölgede yaşayan yöre halkının memnuniyet düzeyinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Murat Nehri yağış havzasında yer alan Bingöl ilinde doğal kaynakların yanlış kullanılması, ormanlık alanlar ile meraların bilinçsizce yakacak, yapacak ve hayvan yemi amaçlı kullanılması sonucu havzalarda erozyon, sel ve heyelan gibi doğal afetler meydana gelmektedir. İncelenen bu 4 mikrohavzada 400 denek üzerinde anket çalışması yapılmıştır. Örneklem seçimi yapılırken her mikrohavzadaki hane sayısı göz önüne alınmış ve her mikrohavzanın %10’u seçilmiştir. Seçim işlemi tesadüfi örneklem yöntemi kullanılarak belirlenmiştir. Denekler üzerinde yapılan anket çalışmasından sonra gerekli veriler SPSS programına aktarılmış ve tanımlayıcı analizler yapılmıştır. Yapılan bu analizlerden frekans dağılımları ve oransal durumlar belirlenmiş ve sonuçlar elde edilmiştir. Aynı zamanda standart sapma ve ortalama değerler tespit edilerek önem derecelerine göre düşük, orta ve yüksek katılım dereceleri tespit edilmiştir. Anket sonuçlarına göre yöre halkının bölgede yapılan Murat Nehri Havzası Rehabilitasyon Projesi’nin (MNHRP) genel olarak memnuniyet ile karşılandığı tespit edilmiştir. Bingöl İli Lediz, Vahkin-Çanakçı, Göynük ve Çapakçur mikrohavza projelerinden yöre halkının memnuniyet düzeyinin belirlenmesi çalışması ile elde edilen önemli veriler aşağıdaki şekilde özetlenebilir. Tarım ve sulama faaliyetlerinden memnuniyet oranları incelendiğinde genel olarak sulama sistemleri faaliyetlerinden, sulama tesisleri faaliyetlerinden, hayvan içme suyu faaliyetlerinden ve hayvan barınaklarının iyileştirilmesinde memnuniyetin çok önemli düzeyde olduğu belirlenmiştir. Mera ıslahı çalışmalarına bakış açıları incelendiğinde; merada gölgelik, sıvat, tuzluk, kaşınma kazığı gibi hizmetlerden memnuniyetin çok fazla olduğu, münavebeli sistem uygulamalarından memnuniyetin önemli düzeyde olduğu, benzer şekilde bilinçlendirme faaliyetlerinde önemli bulunduğu anlaşılmaktadır. Enerjiye dayalı yapılan faaliyetlerden memnuniyet düzeyinin çok yüksek olduğu tespit edilmiştir.; ABSTRACT: With this research, it was aimed to determine the level of satisfaction of local people living as Lediz, Vahkin-Çanakçı, Göynük and Çapakçur which in these regions from the projects applied micro catchments in Bingöl. Such as erosion, floods and landslides natural disasters are happening in Bingöl, which is located in the Murat river rainfall basin, when the natural resources are used improperly and forest areas are used unconsciously. When sampling is selected, the number of households in each micro-basin is taken into consideration and 10%of each micro-basin is selected. The selection process was determined using the random sampling method. After the questionnaire survey on the subjects, the necessary data were transferred to the SPSS program and descriptive analyses were carried out. Frequency distributions and proportional states were determined from these analyses and the results were obtained. At the same time, standard deviation and mean values were determined and low, medium and high participation scores were determined according to importance ratings. According to the survey results, it is determined that the people of the region are satisfied with the Murat River Basin Rehabilitation Project (MNHRP) made in the region with general satisfaction. Determination of the satisfaction level of the local people the important data obtained by Lediz, Vahkin-Çanakçı, Göynük and Çapakçur mikro catchment projects in Bingöl city and it can be summarized as follows. When the satisfaction rates of agriculture and irrigation activities are examined, it was been determined that satisfaction was very important in general irrigation system activities, irrigation facilities activities, animal drinking water activities and improvement of animal shelters. When examining the perspectives on pasture rehabilitation studies; It was understood that satisfaction with services such as grassland canopy, plaster, salt, and itchy piles is very high, satisfaction with the application of the system is significant, and it was also important in awareness raising activities. It was been determined that the level of satisfaction from energy-based activities is very high. Fri, 01 Jan 2016 00:00:00 GMT https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6201 2016-01-01T00:00:00Z https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6178 Karlıova (Bingöl) İlçesinin Etnobotanik Özellikleri NADİROĞLU, Muharrem ÖZET: Bu çalışmada; Bingöl iline bağlı Karlıova ilçesi ve köylerinde 2013-2016 yılları arasında, yerel halk tarafından tıbbi, gıda ve diğer amaçlar için kullanılan bitkiler, bu bitkilerin kullanılan kısımlar ve kullanım şekilleri araştırılmıştır. Araştırma sırasında Karlıova merkezi ve 23 köyünden 220 kişi ile görüşülmüştür ve 60 kişi kaynak kişi olarak belirlenmiştir. Bitki kullanımı konusunda bilgi alınan kaynak kişilerin 33’ü erkek ve 27’si kadındır. Görüşülen kişilerin 1’i üniversite, 1’i lise, 26’sı ilkokul mezunu ve 31 kişi ise okuryazar değildir. Bilgi alınan kişilerin meslek dağılımı şu şekildedir; 26 ev hanımı, 30 çiftçi, 1 öğretmen, 1 iş adamı, 1 işçi ve 1 çalışmayan şeklindedir. Araştırma sonucunda çeşitli amaçlar için kullanılan 33 familyaya ait toplam 121 bitki taksonu ve bu bitkilere ait 280 yöresel kullanım şekli tespit edildi. Kullanım durumu hakkında bilgi toplanan bitkilerin 71’i tıbbi amaçlı, 13’ü gıda, 27’si gıda ve tedavi amaçlı, 4’ü süpürge yapımı, 3’ü boyar madde, 3’nün farklı amaçlarla kullanımlarının olduğu pespit edildi. Kullanılan bitkilerden 15 taksonun faydalı kullanımı ilk defa bu çalışmada belirlendi. Araştırma alanında kullanımı belirlenen bitkilerin kullanılan kısmı ve oranları şöyledir; Toprak üstü kısımları (% 26), Yaprak (% 18), Toprak altı kısımları (% 15), Meyve (% 13), Çiçek (% 10), Tüm bitki (% 9), Gövde (% 6), Tohum (% 3), Diğer (% 4). Araştırma alanında kullanımı belirlenen bitkilerin yoğun olarak dağıldığı 5 familya sırasıyla; Asteraceae 19 (% 15,7), Rosaceae 14 (% 11,6), Apiaceae 12 (%10), Lamiaceae 12 (%10), Fabaceae 10 (% 8,3)’dir.; ABSTRACT: In this study, the plants in the district of Karlıova (Bingöl) and its villages, that are used by local people for medicine, food and different purposes, used parts of this plants and their usage were researched between 2013 and 2016. During our researches, it was interviewed with 220 people from Karlıova and its 23 villages, and 60 of them were determined as sources. The source contacts who are taken knowledge about plant usage consist of 33 male and 27 female. Education status of the participants were stated one as bachelor’s, one as high school graduate, 26 as primary school graduate while 31 as illiterate. Occupational distribution of these persons from whom information was taken are as follows; 26 housewifes, 30 farmers,1 teacher, 1 busines man,1 worker and 1 unemployed. As a result of the research a totol of 121 plant taxa belonging to 33 families used for different purposes and 280 different local usage of these plants were determined. It was found that 71 of the plants obtained information about its usage were used for medical purposes, 13 for food, 27 for food and medical, 4 for tree heath, 3 for colourant and 3 for different purposes. The useful usage of 15 taxa were determined for the first time in this study. Used parts and ratios of the plants whose usage was determined in the study ar as follows; Aboveground parts (26%), Leaf (18%), Underground parts (15%), Fruit (13%), Flower (10%), Whole plant (9%), Stem (6%), Seed (%3), Other (4%). The 5 families in which the plants whose usage was determined in the research area were intensely ranged are Asteraceae 19 (15,7%), Rosaceae 14 (11,6%), Apiaceae 12 (10%), Lamiaceae 12 (10%), Fabaceae 10 (8,3%), respectively. Sun, 01 Jan 2017 00:00:00 GMT https://acikerisim.bingol.edu.tr/handle/20.500.12898/6178 2017-01-01T00:00:00Z